O3自由的漂浮在空氣及水中，當臭氧與病菌、病毒、化學性質、重金屬等像接觸時，于是它的一個氧原子就與它分離，同病菌、病毒、化學物質、金屬等相結合而生成有益的化合物。
　　
　　現在來觀察臭氧是怎么工作的。它的殺菌過程是釋放第三個氧原子攻破病菌細胞壁、細胞膜以及病毒的蛋白殼體，氧化的結果是氧原子滲透到病菌的細胞核中，直接 破壞RNA和DNA，使其溶解最后生成別的安全的有氧化合物。因為臭氧有很強的殺菌能力，所以每升水中僅需要幾毫升臭氧就足夠摧毀，殺死水中所有的有害病 菌。一個例子是甲醛（HCHO)與臭氧結合會生成CO2、水和氧氣。臭氧能清潔我們的自然環境，氧與臭氧轉換就象自然界中水的轉換一樣。